Một hôm nọ, Takashi Natsume, một thằng nhóc có khả năng nhìn thấy ma quái, tình cờ phát hiện ra một cuốn sổ tên là “hữu nhân sổ”, là di sản của bà cậu. Sau khi mở cuốn sổ ra, Natsume quyết định trả lại tên cho những yêu quái được ghi trong đó, cùng với sự giúp đỡ của Nyanko-sensei, một con mèo chà bá trở thành người bảo vệ cậu vì lý do nào đó. Từ đấy, câu chuyện ấm lòng bắt đầu…