Ở “thành phố gakuen” khổng lồ phía Tây Tokyo, có một khóa học siêu kỳ lạ nhằm phát triển khả năng siêu nhiên của bọn học sinh. Nhân vật chính, Accelerator, là một tên mạnh nhất trong nhóm giỏi giang, nhưng cuộc đời anh đã trở thành một chuỗi thí nghiệm kỳ quặc và anh từng bị đánh bại khi mải miết tìm kiếm sức mạnh tối thượng. Tuy nhiên, sau khi gặp gỡ một cô gái, mọi thứ trong cuộc đời anh bắt đầu thay đổi hoàn toàn…