Trong một năm kể từ khi thế hệ thứ 77 gia nhập AKB0048, Tổ chức Thương mại Thiên hà Sâu (DGTO) và DES đã bắt đầu tăng cường các cuộc tấn công vào ngành giải trí. Để ứng phó, AKB0048 đã tổ chức một cuộc bầu cử lớn và tìm kiếm vị trí center nova. Các học viên giờ đây phải tham gia vào một cuộc cạnh tranh khốc liệt với những người đi trước. Tuy nhiên, khi AKB0048 phát động các chính sách chưa từng thấy từ khi Acchan biến mất, một kẻ thù mới, mạnh mẽ hơn, đang lén lút hoạt động sau hậu trường.