Dựa theo cuốn thứ hai trong series nổi tiếng của J.K. Rowling, bộ phim này xoay quanh cuộc sống của Harry Potter trong năm học thứ hai tại trường phù thủy Hogwarts. Lòng háo hức của Harry khi trở lại ngôi trường yêu thích của mình đã bị phá vỡ bởi một chuyện kỳ lạ. Một chú gia tinh mang tên Dobby xuất hiện để cảnh báo cho Harry về những rắc rối đang rình rập cậu, thậm chí còn cố ép cậu không được đi học nữa. Nhưng mà Harry vẫn quyết tâm quay lại nơi mà cậu consider như ngôi nhà thứ hai của mình.
Thế nhưng, Hogwarts lại đứng trước nguy cơ phải đóng cửa mãi mãi khi những sự kiện kỳ quái liên tục xảy ra: Vết máu lạ xuất hiện trên tường, học sinh các Nhà dần dần bị biến thành đá, cùng những bí ẩn rùng rợn về một căn phòng bí mật. Cuối cùng, Harry còn phát hiện mình có khả năng nghe thấy những âm thanh kỳ lạ, phát ra từ trong bức tường.
