Câu chuyện diễn ra trong một bối cảnh giả tưởng của Thế chiến II tại một thành phố quốc tế ở châu Á. Tại Nhật Bản, Trung tá Yuki (do Yusuke Iseya thủ vai) quyết định lập ra một trường đào tạo gián điệp có tên là “D Kikan”. Trong lúc đấy, Kato (Kazuya Kamenashi) đang bị xử án tử hình vì dám trái lệnh cấp trên. Trong hoàn cảnh ngặt nghèo, anh được “D Kikan” chú ý và chọn tham gia chương trình đào tạo.
Kato trải qua những thử thách khắc nghiệt trong khóa huấn luyện và chuẩn bị cho nhiệm vụ đầu tiên của mình với vai trò điệp viên. Nhiệm vụ này yêu cầu anh phải thu thập tài liệu mật mang tên “Black Note” của Đại sứ Mỹ, Graham. Để hoàn thành, Kato phải thâm nhập vào thành phố quốc tế, nơi mà cuộc chiến giành quyền sở hữu “Black Note” đang diễn ra quyết liệt giữa anh, một cô gái bí ẩn tên Rin (Kyoko Fukada), các cơ quan tình báo Anh, Liên Xô, và cả những quân đội cực đoan trong nước.