Mê Cung Long Ẩn nói về chuyện xảy ra khi “thuyền ma” cập bến Hồng Kông. Ông chủ của nó, để tự bảo vệ bản thân, quyết định đẩy nhanh giải quyết vụ án như một cuộc “loạn thủy tặc”. Nhưng Địch Nhân Kiệt lại cảm thấy có điều gì đó không ổn. Gần đến đại lễ, dân Trường An vì vụ việc này mà hoảng loạn, hoàng hậu đã sai Thần Minh, kẻ đứng đầu Đại Lý Tự, phải giải quyết vụ án này trong vòng ba ngày. Nhưng mà, đáng tiếc là hắn lại đem áp lực này cho Địch Nhân Kiệt.
Còn tên Lãnh Tế Nguyệt, trưởng quan Đốc Thủy Giám cũng tham gia vào chuyện này. Trong khi kiểm tra trên thuyền ma, hắn tình cờ gặp lại người bạn cũ Đoạn Ngôn. Ba người họ cùng kéo nhau đến trung tâm tình báo ở Trường An để tìm kiếm thông tin. Sau một thời gian khám phá, hai thế lực ngầm tại Trường An cuối cùng đã tìm ra nơi giấu bí mật – Vân Quật.
Khi Địch Nhân Kiệt và nhóm của hắn vào Cổ Lăng Vân Quật, họ phải đối mặt với vô vàn bẫy và cơ quan. Tuy nhiên, họ bị rơi vào tình thế cực kỳ khó khăn. Nhờ vào khả năng đoán diện tích mặt đất, Địch Nhân Kiệt tìm được lối thoát, và cuối cùng khám phá mộ Dương để phát hiện ra nơi cất giấu của Hoài Vương cùng di tích của Đại Nguyệt nuôi dưỡng Long Ngao.
Sự thật ngày càng sáng tỏ, cùng lúc đó đại điển đang đến gần, các thế lực hắc ám đang chờ thời cơ để ra tay. Địch Nhân Kiệt đã sớm nhận ra điều gì đang xảy ra và đã chuẩn bị sẵn một kế hoạch hoàn hảo để đối phó.