Năm L.C. 922, mọi thứ đang yên lành bỗng dưng rối ren khi một cuộc khủng hoảng ập đến bất ngờ. Tại Tetra Heaven, nơi có nhiều huyền thoại, sau một trăm năm chiến tranh, các vị thần đã thua và giờ đang tìm chỗ trú thích hợp. Họ cuối cùng tìm thấy một nơi gọi là Septpia, thế giới của con người, nơi mà họ quyết định bắt đầu một cuộc tấn công.
Để đối phó với tình hình này, những nhà Logic học trong đội ALCA, một lực lượng đặc biệt chuyên bảo vệ các thành phố khỏi sự xâm lấn của các sinh vật đến từ nơi khác (tức là thiên thần), buộc phải vào cuộc, bất kể họ có muốn hay không. Tùy theo khả năng của mỗi người, các nhà Logic học có thể “gọi hồn” những nữ thần từ những thế giới khác để cùng chiến đấu.
Câu chuyện có sự xuất hiện của Yoshichika Tsurugi, một chàng trai bình thường chẳng có tí “Logic” nào, và đang sống cuộc sống êm đềm cùng gia đình. Rồi bỗng dưng, anh bị cuốn vào cuộc xâm lược và phải cùng mọi người tìm chỗ trú. Trong lúc hoảng loạn, anh gặp một nữ thần xinh đẹp tên là Athena. Cô ấy sở hữu thứ “Logic” mà Yoshichika đang thiếu thốn. Thế là cả hai, Yoshichika và Athena, cùng nhau lên đường tới số phận đang đợi chờ họ.
