Câu chuyện diễn ra trong một thế giới đầy huyền bí và mang màu sắc gothic, xoay quanh nhân vật Teito Klein. Cậu là một nô lệ mồ côi, nhưng lại xuất sắc đến nỗi trở thành học viên giỏi nhất tại Học viện Quân đội. Nhưng rồi, một biến cố ập đến khiến cậu bị quân đội của Đế quốc Barsburg truy lùng. Để tránh bị kết án, cậu được nhà thờ bảo vệ nhờ vào quy tắc của nơi thiêng liêng.
Tại đây, Teito khám phá ra nhiều bí mật liên quan đến bản thân, nhà thờ và Đế quốc. Thực ra, cậu có mối liên hệ với một vị vua bị lật đổ và một viên đá thần kỳ mang tên “con mắt của Mikhael.” Đó chính là lý do khiến Đế quốc gắt gao săn đuổi cậu. May mắn cho Teito, trên đường trốn chạy, cậu được sự giúp đỡ của các linh mục trong nhà thờ và những Hồn Ma huyền thoại, 7 Ghost.
Liệu Teito có thể trốn thoát khỏi sự săn đuổi của quân đội? Thân phận thực sự của cậu là gì? Và vị tham mưu trưởng Ayanami, rốt cuộc là một người ra sao…?