“9” kể về một thế giới sau tận thế, nơi mà con người bị diệt vong bởi chính những cỗ máy do họ sáng tạo ra. Tuy nhiên, sau một thời gian, đám máy móc đó cũng dần yếu đi vì hết nguyên liệu. Điều duy nhất giúp chúng tồn tại là năng lượng, hay nói dễ hiểu hơn là linh hồn, đang ngự trị trong những con búp bê vải nhỏ xinh. Những búp bê này được một nhà khoa học bí ẩn chế tạo ra, với hy vọng rằng một ngày nào đó, những linh hồn này sẽ cứu rỗi nhân loại.
