Ở cái “thành phố học đường” nơi mà học sinh chiếm đến 80% dân số, các thí nghiệm để phát triển siêu năng lực đang diễn ra rầm rầm, và học sinh thì được phân loại thành các cấp từ 0 đến 5. Mikoto Misaka, với cấp độ 5, là người có khả năng điều khiển điện, đã có một kỳ nghỉ hè vui vẻ bên Kuroko Shirai, Kazari Uiharu, Ruiko Saten và vài người bạn khác, trong khi cũng giải quyết không ít vụ án thú vị. Trong những tháng ngày bình thường như vậy, một lần gặp gỡ sẽ sắp thay đổi hoàn toàn cuộc đời cô…
