Đúng một năm sau khi cái ông vua tàn bạo nhất của Britannia “rời khỏi cuộc chơi,” thế giới như được thở phào nhẹ nhõm vì hòa bình đã trở về dưới sự dẫn dắt của Liên đoàn các quốc gia thống nhất. Nhưng cái cảm giác yên ả chẳng kéo dài lâu khi nhóm chiến binh vũ trang bất ngờ đánh cắp cựu công chúa Nunnally vi Britannia và Suzaku Kururugi, cố vấn hàng đầu của Black Knights. Điều này đã khiến một cuộc khủng hoảng quốc tế nổ ra.
