Câu chuyện bắt đầu ngay sau phần đầu của phim “Death Note”, khi Light Yagami gia nhập vào đội ngũ điều tra, nhằm truy tìm kẻ giết người hàng loạt mang tên “Kira”. Dù L luôn nghi ngờ Light chính là “Kira”, nhưng Light lại đang tìm cách tìm ra tên thật của L để có thể ra tay tiêu diệt anh ta bằng quyển sổ thần kỳ Death Note.
