Nhiều năm sau khi một thằng nhóc ở Mỹ mất đi một con bạn Digimon thân thiết, giờ đây, một con Digimon virus xấu tính bắt cóc những đứa trẻ được chọn. Những đứa bạn nhỏ cùng với các Digimon của mình phải vào cuộc, nhanh chân tìm ra bí ẩn đằng sau mối nguy hiểm này trước khi quá trễ.
