Cuộc Chiến Chén Thánh lần thứ năm vẫn đang diễn ra và mọi thứ đã trở nên rối ren hơn bao giờ hết, khiến cho stakes (tiền cược) cho các chiến binh tham gia càng lớn. Shirou Emiya không chịu đứng ngoài, anh muốn trở thành một anh hùng, một người bảo vệ công lý giúp đỡ mọi người. Anh bắt đầu đi tìm hiểu điều gì đang xảy ra với cái bóng bí ẩn kia và những vụ án mạng cũng như quyết tâm phải đập tan nó.
