Tiếp tục câu chuyện còn dang dở từ hai phần trước, “Hồ sơ công lý III” quay trở lại như một cách bày tỏ lòng tri ân của đạo diễn Đặng Đặc Hy gửi đến những khán giả trung thành của TVB. Phần III này có nhiều nhân vật mới đầy kịch tính, đưa ra những mâu thuẫn đáng suy ngẫm giữa luật pháp và cảm xúc con người. Nhiều vụ án gây sốc đã xảy ra: Có một cái chết vì tình nhưng lại trở thành vụ cưỡng hiếp? Hai người đàn ông lại bị buộc tội giết bạn gái của họ? Tình yêu mẹ thiêng liêng thường được ngợi ca, nhưng giờ đây lại là lý do để có những hành động phạm pháp? Rồi còn là những thảm kịch trong gia đình; cảnh sát lẫn nhau bị bắn; những sự cố trong lĩnh vực y tế dẫn đến hậu quả nghiêm trọng; thậm chí, có vụ án đã đóng hồ sơ mười mấy năm nhưng giờ đây lại phải xem xét lại…