Sau khi cha mất một cách tàn nhẫn, Ryuuko Matoi không ngừng lang thang để truy tìm kẻ đã hại ông. Cô chỉ có một đầu mối duy nhất – chiếc Lưỡi cắt kéo, phần còn lại trong phát minh của cha cô. Cái mà cô muốn tìm kiếm đã dẫn dắt cô đến Học viện Honnouji, một ngôi trường trung học nổi tiếng đầy bí ẩn và khác biệt so với những nơi khác.
