Câu chuyện này xoay quanh việc một sinh vật ngoài hành tinh gọi là Kí Sinh Trùng đến trái đất. Chúng có cách tấn công kỳ lạ, xâm nhập vào cơ thể qua tai hoặc mũi, sau đó chiếm lĩnh não bộ và điều khiển con người. Một con Kí Sinh Trùng tên là Migi lại chỉ thôn tính được cái tay phải của một cậu học sinh cấp ba, Shinichi Izumi. Tuy nhiên, Migi không thể kiểm soát hoàn toàn hành vi của cậu. Thay vì đối bịch, cả hai đã học cách sống hòa hợp với nhau và bắt đầu chiến đấu chống lại những Kí Sinh Trùng khác, là những kẻ chỉ coi loài người như thức ăn.
