Câu chuyện xoay quanh bối cảnh năm 2067, tức là tám năm sau những sự kiện xảy ra trong phiên bản Macross Frontier năm 2008. Nội dung phim vẫn tiếp tục mang đến cho khán giả những trận chiến bay siêu ngầu bằng máy bay Valkyrie và những bản nhạc đầy cảm xúc, điều mà chúng ta đã quen thuộc từ trước đến nay.
