Sau khi bay xa Trái Đất hàng tỉ cây số, chiếc tàu vũ trụ Macross chở theo một thành phố gồm đủ dân thường và lính về nhà. Họ không ngừng chiến đấu chống lại cơ hội bị tấn công từ các chủng tộc ngoài hành tinh khổng lồ, Zentradi và Meltrandi, những kẻ mà con người đã phải đối mặt trong cuộc chiến này.
