Sau khi liều mình thoát ra khỏi Bảo tàng Ký ức, Sayaka Miki quyết định về Thành phố Mitakihara với tâm trạng không yên. Cô mang theo một thông tin khá nghiêm trọng. Bận tâm về những điều mình đã trải nghiệm, Sayaka chia sẻ với Madoka Kaname và Homura Akemi về nơi ở của Mami Tomoe. Nhưng quan trọng hơn, cô còn tiết lộ sự thật đáng sợ liên quan đến việc tồn tại của các cô gái phép thuật.
