Madoka Kaname và cô bạn thân Sayaka Miki là hai cô bé bình thường đang học trung học ở thành phố Mitakihara. Thế nhưng, một hôm nọ, mọi chuyện bỗng trở nên khác thường khi họ gặp một sinh vật giống mèo lạ lùng tên là Kyuubey. Sinh vật này nói rằng nó có khả năng đáp ứng một điều ước của họ.
