Annie và Jack phát hiện ra một ngôi nhà trên cây rất đặc biệt, nơi có những cuốn sách dẫn dắt họ đến hàng loạt địa điểm khác nhau trong thời gian. Câu chuyện bắt đầu với một ngày nọ ở Frog Creek, Pennsylvania, khi cậu bé Jack 8 tuổi và cô bé Annie 7 tuổi tình cờ tìm thấy ngôi nhà trên cây trong khu rừng gần nhà. Trong 36 chương đầu, hai anh em này bắt đầu một cuộc phiêu lưu đầy thú vị, khám phá lịch sử, văn hóa, nghệ thuật, âm nhạc, khoa học và cả những hiện tượng tự nhiên chỉ qua việc chỉ vào một nơi nào đó trong sách và ước rằng họ có thể tới đó. Trong hành trình kỳ diệu đó, họ gặp Morgan le Fay – chủ nhân ngôi nhà trên cây, người đã giúp họ trở thành những thủ thư tài ba và giao cho họ nhiều nhiệm vụ thú vị.
