Cái tính hỗn loạn của Sonic the Hedgehog đã khiến cho những viên ngọc lục bảo đa sắc mà mọi người đều thèm muốn bị kẹt lại trong cơn bão, khiến chúng trở nên mất kiểm soát ngay trước khi được kích hoạt. Hệ quả là hệ thống kiểm soát hỗn loạn tràn về và làm tê liệt mọi thứ trong bán kính hàng dặm quanh căn cứ của Tiến sĩ Eggman. Với tất cả điều hỗn độn như vậy, không ai có thể đoán được chuyện gì sẽ xảy ra tiếp theo.
