Dù cho Quinella, giáo chủ của Giáo hội Chân lý, đã thất bại nhưng tình hình vẫn chưa nguôi ngoai. Khi trở lại với cuộc sống thực, Kazuto “Kirito” Kirigaya phát hiện rằng chiếc phao Ocean Turtle – một siêu dự án của Rath – đã bị tấn công. Lúc này, sự cố mất điện bất ngờ do kẻ địch gây ra đã làm hỏng Fluctlight của Kirito, khiến cho anh rơi vào trạng thái hôn mê.
