Câu chuyện diễn ra trong một thế giới huyền bí với phong cách gothic, xoay quanh nhân vật Teito Klein. Cậu là một chàng trai mồ côi, từng là nô lệ nhưng đã vươn lên thành học viên xuất sắc nhất của Học viện Quân đội. Thế nhưng, một sự việc bất ngờ xảy ra đã khiến cậu phải chịu đựng sự truy lùng gắt gao từ Đế quốc Barsburg. Để giúp cậu thoát khỏi kết cục tồi tệ, nhà thờ đã giương tay bảo vệ theo những quy tắc ngặt nghèo của nơi thánh thần.
Tại đây, Teito bắt đầu khám phá ra nhiều điều bí ẩn liên quan đến bản thân, nhà thờ và cả Đế quốc. Cậu thật sự có mối liên hệ với một vị vua bị phế truất và một viên đá bí ẩn của thượng đế mang tên “Con mắt của Mikhael”, từ đó khiến cậu trở thành mục tiêu săn lùng của Đế quốc. Trong hành trình thoát thân, Teito được nhóm linh mục của nhà thờ và một nhóm trong truyền thuyết gọi là 7 Hồn Ma – 7 Ghost bảo vệ.
Cuối cùng, liệu Teito có thể tránh khỏi sự chạm trán với Quân đội? Thân phận thật sự của cậu là gì? Và Ayanami – tham mưu trưởng ấy, rốt cuộc là ai? Những câu hỏi này sẽ dẫn dắt cậu vào một cuộc phiêu lưu đầy kịch tính và bí ẩn.
