Bộ phim “Cuộc Vượt Ngục Cuối Cùng” bắt đầu với việc Sara bị bắt ngay trong ngày cưới của cô với Michael. Nguyên nhân là vì cô bị nghi ngờ là giết Christina Scofield. Trong nhà giam nữ, Sara gặp gỡ một số tù nhân mới và cũng phải chịu cảnh bị đòn của các quản giáo do chuyện vượt ngục ở nhà tù Fox River trước đó.
Phía bên nhà tù nam, General Krantz và T-Bag đang bị giam. Khi biết tin Sara bị bắt và đang ở trong tù đối diện, Krantz quyết định chi 100.000 đô la để thuê người ám sát cô. Rất may là Sara chưa bị giết, nhưng cô lại bị đầu độc và phải chữa trị gấp. Mà kỳ lạ thay, vì cô đang có thai nên phải uống thuốc thúc sinh, một chuyện mà Sara không hề chuẩn bị tâm lý.
Giữa bao nhiêu nhiêu sóng gió, Michael quyết tâm tìm cách giải cứu vợ mình. Anh nghiên cứu tình hình trong tù và lập kế hoạch cùng với Lincoln và Sucre. Lần vượt ngục này hứa hẹn trở nên khó khăn, nguy hiểm hơn bao giờ hết. Liệu họ có thể thành công trong cuộc chạy trốn này không?
