Giai đoạn tiếp theo của cuộc chiến battle royale, gọi là Kế hoạch Sekirei, đang diễn ra căng thẳng. Shintou Teito giờ đây đã bị khóa chặt; không ai, từ Sekirei đến Ashikabi, có thể rời khỏi đây. Minato Sahashi và nhóm Sekirei của anh giờ phải sẵn sàng cho những trận chiến mới khi mọi quy tắc lại đang bị thay đổi.