Đã một năm trôi qua kể từ khi câu lạc bộ bơi lội ở trường trung học Iwatobi được lập ra, nhưng vẫn chưa có ai muốn tham gia cả. Bây giờ Haruka Nanase và Makoto Tachibana đã là học sinh cuối cấp, cùng với hai người bạn nhỏ tuổi hơn là Nagisa Hazuki và Rei Ryuugazaki, phải nghĩ cách để thu hút thêm thành viên mới. Nếu không tìm được người, có khả năng cao là câu lạc bộ sẽ phải đóng cửa vào năm tới vì không đủ số lượng người tham gia.