Sau khi kết thúc loạt phim, nhóm phi hành đoàn DenLiner phát hiện ra rằng Ryotaro đã bị một tên chúa tể ác độc chiếm đoạt. Hắn muốn phá hủy dòng thời gian với mục đích hồi sinh những người đã chết. Lực lượng duy nhất có thể ngăn cản hắn chính là Den-O mới, một cậu cháu trai của Ryotaro từ tương lai về.
